办公室
负责机关、所属单位和全国及海外各团体会员的综合协调工作；承担协会重大活动、会议的安排和组织；负责机关文秘、档案、行政管理、财务、机关人事、党务、纪检监察管理等工作。

会员工作部
负责会员的联络、组织、管理工作；负责发展会员，收缴会费；建立会员艺术档案；维护会员的知识产权等合法权益；组织美术家采风、深入生活，对各创作中心进行联络与管理。

展览部
承办协会主办的国展览，负责展览的策划、组织、发动、实施等各项具体工作；主办会员作品展览及其它展览。

对外联络部
综合协调好和组织协会对外艺术交流以及与香港特别行政区、澳门特别行政区和台湾地区的艺术交流；负责组织画家出访，负责邀请和接待国外（境外）画家的来访，承办协会的外事工作。

艺术委员会
为繁荣艺术创作，开展学术研究，中国青年美术家协会成立艺术委员会。艺术委员会为学术性咨询机构，其主要任务是：研究当前创作中的重大问题，研究协调、审批各专业艺术委员会的活动安排以及审定活动经费等重大事项。
艺术委员会下设各专业艺术委员会。其主要任务是：组织本专业的全国及海外会员，进行艺术创作，开展学术研究，举办作品观摩展览，制定本专业艺术委员会的活动计划。

现成立的专业艺术委员会有：
中国青年美协中国画艺术委员会
中国青年美协油画艺术委员会
中国青年美协版画艺术委员会
中国青年美协雕塑艺术委员会
中国青年美协水彩画艺术委员会
中国青年美协漆画艺术委员会
中国青年美协壁画艺术委员会
中国青年书协陶瓷艺术委员会
中国青年美协插画装帧艺术委员会
中国青年美协连环画艺术委员会
中国青年美协漫画艺术委员会
中国青年美协理论委员会
中国青年美协工业设计艺术委员会
中国青年美协艺术委员会
中国青年美协唐卡工艺委员会
中国青年美协平面设计艺术委员会

研究部
负责研究艺术创作动向；组织美术理论研究、学术交流和培训活动；负责协会重要文件的起草；负责重大展事的组织和评选活动；对各培训中心进行联络和管理。

培训中心
为开展高级绘画艺术专业人才的培训工作，加强会员的艺术修养、提高会员的创作水平。